Si jamais, pour une raison ou pour une autre votre installation Nextcloud se retrouve en rade et tant que le dossier data est encore en état et que vous avez une BDD MySQL, il est facile de retrouver une installation propre avec toutes les données :

1. Renommez le dossier de Nextcloud (cloud en cloud-bak par exemple);
2. Faites une réinstallation dans un nouveau dossier;
3. Créez un nouveau compte administrateur sur la même BDD que l'ancienne install;
4. Connectez-vous à votre cloud, puis déconnectez-vous;
5. Reconnectez-vous avec le compte administrateur de l'install en rade;
6. Supprimer le nouveau compte admin;
7. Par FTP, copier le dossier data de l'ancienne install dans la nouvelle;
8. Réinstallez les différentes applications que vous utilisiez;
9. Et voilà (enfin, normalement !) Pour ma part, j'ai récupérer l'intégralité de mes données.

Coup de chaud et tout le tralala pour ma part. J'ai pété mon instance en moins de temps qu'il n'en faut pour le dire et cette manip' m'a "sauvé".